Eesnäärmevähk: suured andmed avavad 80 uut ravimi sihtmärki
Suurimas uuringus, milles analüüsiti eesnäärmevähi geneetikat, leiavad teadlased mitte vähem kui 80 uut potentsiaalset ravimi sihtmärki. Projekt avab uued võimalused uute raviviiside kujundamiseks.
Geneetiliste andmete väljavõtmine oli kunagi ammu tülikas ja uskumatult aeganõudev ülesanne.
Kuna aga tehnoloogia areneb jätkuvalt, on töö muutunud oluliselt kiiremaks ja odavamaks.
Paralleelselt on suurte andmekogumite käsutamiseks saadaval olevad tööriistad oluliselt paranenud.
Kokkuvõttes tähendab see, et geneetilisest koodist korjatud teabe ookeane saab uue selguse saavutamiseks analüüsida, kaardistada ja suhteliselt hõlpsalt kombineerida.
Hiljuti kasutas rahvusvaheline meeskond eesnäärmevähi geneetikasse süvenemiseks seda DNA-analüüsi ja suurte andmete kahepoolset lähenemist. Haiguse soomuses olevate molekulaarsete chinkide jahtimisel korraldas uuringud Ühendkuningriigis Londonis asuv vähiuuringute instituut.
Eesnäärmevähi väljakutsed
Eesnäärmevähk on meeste seas teine levinum vähk Ameerika Ühendriikides. Sel aastal on USA-s hinnanguliselt 164 690 uut eesnäärmevähi juhtumit ja peaaegu 30 000 selle haiguse surma.
Ehkki teadlased on eesnäärmevähi mõistmisel ja ravimisel edenenud, on siiski mitmeid raskusi.
Nagu uuringu juht prof Rosalind Eeles selgitab: "Üks väljakutseid, mis vähi uurimisel silmitsi seisavad, on haiguse keerukus ja suur hulk võimalusi, kuidas saaksime seda ravida."
Suurbritannia vähiuuringute doktor Justine Alford visandab eesnäärmevähi uurimisel ja sekkumisel veel ühe teema.
"Suur takistus eesnäärmevähi vastu edasise progressi saavutamisel," selgitab ta, "on viiside puudumine, mis võimaldaksid täpselt ennustada, kuidas inimese haigus areneb, mistõttu on keeruline teada, milline ravi on iga patsiendi jaoks parim."
Geneetiliste andmete kogumine
Uuest suunast probleemile lähenemiseks võtsid teadlased geneetilise teabe 112 eesnäärmevähiga mehelt ja ühendasid selle paljude teiste uuringute andmetega. Kokku kasutati 930 patsiendi proove.
Kasutades uusimaid suurandmete tehnikaid, sai meeskond uue ülevaate geneetilistest muutustest, mis soodustavad eesnäärmevähi arengut ja soodustavad selle progresseerumist. Kui nad olid aru saanud, millised geenid on seotud, võivad nad luua kaardi valkudest, mida need geenid kodeerivad.
Järgmisena pöörduti andmebaasi canSAR poole, mis ühendab uuringute andmeid, rakendab masinõpet ja aitab anda ülevaate ravimite avastamisest.
CanSAR selgitab oma veebisaidil küsimusi, millele nende andmebaas soovib vastata: „Mis on valk teada, millistes vähkides see avaldub või muteerub ning milliseid keemilisi vahendeid ja rakuliini mudeleid saab kasutada selle aktiivsuse proovilepanekuks? Mida teatakse ravimist, selle rakutundlikkusprofiilist ja milliseid valke see teadaolevalt seob, mis võib seletada ebatavalist bioaktiivsust? "
Teadlased leidsid, et 80 valku, mille nad olid avastanud, olid potentsiaalsed ravimi sihtmärgid. Nendest 11 olid suunatud olemasolevate ravimite poolt ja seitsmele teisele said ravimid juba kliinilistes uuringutes.
Nende leiud avaldatakse sel nädalal ajakirjas Looduse geneetika.
"Meie uuringus rakendati suurte andmete analüüsimisel tipptasemel tehnikaid, et saada palju uut teavet eesnäärmevähi ja selle vastu võitlemise võimalike võimaluste kohta."
Prof Rosalind Eeles
Vaadates tulevikku
Enne kliinilist kasutamist saab neid avastusi muidugi põhjalikumalt uurida, kuid need pakuvad mitmeid uusi võimalusi.
Kaasautor prof Paul Workman selgitab: „See uuring on paljastanud märkimisväärselt palju uusi eesnäärmevähi arengut soodustavaid geene ja andnud meile elutähtsat teavet selle kohta, kuidas haiguse bioloogiat võimalike uute ravimeetodite leidmiseks kasutada. ”
Ta loodab, et nende töö "stimuleerib uute uuringute laine geneetiliste muutuste ja [nende] tuvastatud potentsiaalsete uimastisihtmärkide kohta eesmärgiga, et patsiendid saaksid sellest võimalikult kiiresti kasu".
Teine komistuskivi eesnäärmevähi ravimeetodite väljatöötamisel on viis, kuidas haigus kulgeb igal inimesel erinevalt. Seetõttu on palju raskem otsustada, millised ravivõimalused sobivad igale patsiendile kõige paremini.
Dr Alford loodab, et "[mis] aitab meil paremini mõista haiguse geneetikat, […] võiksid need teadmised tulevikus aidata arstidel paremini ravida inimese vähki ja loodetavasti näha rohkem inimesi oma haigusest üle. ”
Need on varajased päevad, kuid järgmise põlvkonna uuringutest tulenevad leiud võivad seda valdkonda muuta.
