"Suurim" mikrobiomi uuring kaalub meie soolestiku tervist
Inimese mikrobioomi kunagi uurinud suurima uuringu esimesed tulemused on olemas. Neil on oluline mõju meie toitumistavadele, antibiootikumiresistentsusele ja vaimsele tervisele.
2012. aastal said San Diegost California ülikoolist (UC) Ph.D. Rob Knight, inimtoiduprojekti asutaja Ph.D. Jeff Leach ja Ph.D. Jack Gilbert. Illinoisis asuva Chicago ülikooli mikrobioomikeskuse õppejõud asus asutama Ameerika soolestiku projekti.
Projekti eesmärk oli rohkem teada saada inimese mikrobioomist - see tähendab geenide kogumist, mis kodeerib kõiki meie mikroobe.
Täpsemalt tahtsid teadlased teada, kui palju bakteritüüpe meie kehas elab ja kus ning kuidas mõjutab meie toitumine ja eluviis nende mikroobide koostist.
Selleks kasutasid nad nn kodanikuteadust - praktikat, kus üldsus panustab teadustöösse, pakkudes analüüsimiseks oma aega ja isikuandmeid.
Projekti esimesed tulemused on nüüd saadaval ja need pakuvad vihjeid selle kohta, mis hoiab meie sisikonna terve ja bakteriliselt mitmekesine. Tulemused avaldati ajakirjas mSüsteemid.
Kodanike teadlased aitavad mikrobiomi uurida
Projekti raames maksid osalejad 99 dollarit komplekti eest, mis kogus bakterite fekaalide, suu ja naha proovid.
Samuti pidid nad vastama küsitlusele, milles küsiti nende üldist tervist ja võimalikke haigusi, nende elustiili ja toitumisviise.
2015. aastal loendati projektis 15 096 proovi, mille esitasid 11 336 inimest kogu Ameerika Ühendriikides, Suurbritannias, Austraalias ja veel 42 riigis.
Seejärel kasutasid teadlased genoomse järjestuse määramiseks geneetilist markerit nimega 16S rRNA, mis on ainulaadne molekul bakteritele.
Nad uurisid ka proovides sisalduvate metaboliitide kogumit, et analüüsida muid molekule ja keemilisi ühendeid, mis võivad esineda.
Lõpuks kasutasid teadlased geneetiliste andmete igakülgseks analüüsimiseks meetodit, mida nimetatakse püssimetagenoomikaks - mis on uuenduslik ja võimas DNA järjestamise meetod.
Mitmekülgse taimse dieedi tähtsus
Esiteks näitavad tulemused, et mitmekesisem taimne toit muudab bakterite mitmekesisema soolestiku.
Täpsemalt, neil, kes tarbisid igal nädalal rohkem kui 30 erinevat tüüpi taimi, olid palju mitmekesisemad mikrobioomid kui neil, kes tarbisid vaid kümmet või vähem taimeliiki nädalas.
Kuid teadlased märgivad, et need tulemused ei tähenda tingimata, et mikroobide mitmekesisuse suurenemine oleks kellegi tervisele positiivne.
Teiseks näisid osalejad, kes teatasid, et söövad rohkem kui 30 taimeliiki nädalas, antibiootikumide suhtes madalam.
Teadlased leidsid nende inimeste väljaheideproovides vähem antibiootikumiresistentsusele viitavaid geene - see tähendab vähem geene, mis aitavad bakteritel ravimitest pääseda.
Kuigi uuring on puhtalt vaatluslik ja ei saa põhjuslikkuse kohta midagi järeldada, oletavad autorid, et isikud, kelle dieet sisaldab vähem taimi, võivad kompenseerida kas liha söömist - mida võib olla ravitud antibiootikumidega - või töödeldud toitu, millele on lisatud antibiootikume .
Soolebakterid ja vaimne tervis
Lõpuks näitas uuring huvitavaid seoseid soolestiku bakterite koostise ja vaimuhaiguste vahel.
Neid, kes teatasid, et elavad traumajärgse stressihäire (PTSD), skisofreenia, depressiooni või bipolaarse häirega, võrreldi tervete kontrollidega, kelle vanus, sugu ja kehamassiindeks (KMI) olid kokku sobitatud.
Tulemused näitasid, et vaimse tervise probleemidest teatanud inimestel oli rohkem sarnaseid probleeme teatanud inimestega võrreldes kontrollrühmadega.
See seos oli tugev olenemata soost, vanusest või geograafilisest asukohast. Samuti viitavad uuringud sellele, et teatud tüüpi bakterid võivad depressiooniga inimestel olla rohkem levinud.
Need leiud tugevdavad varasemate uuringute põhjal seost vaimse tervise ja soolebakterite vahel.
Näiteks tõi hiljutine uuring välja seose ärevuse ja teatud tervete soolestiku mikroobide puudumise vahel. Teine leidis, et PTSD-ga inimestel on teatud bakterid muutunud.
Mikrobiomi GPS-i poole
UC San Diego meditsiinikooli Ameerika soolestiku projekti teadusdirektor, doktor Daniel McDonald kaalub järelduste olulisust. Ta ütleb:
"Me täheldasime palju suuremat mikroobide mitmekesisust kui varasemad leitud väiksemad uuringud ja see viitab sellele, et kui vaatame rohkem populatsioone, näeme rohkem mitmekesisust, mis on oluline inimese mikrobiomi piiride määratlemiseks."
Knight on samasuguse arvamusega, öeldes: "Inimese mikrobioom on keeruline, kuid mida rohkem proove saame, seda kiiremini suudame lahti harutada mikrobiomi mitmel viisil seostamise erinevate tervise- ja haigusseisunditega."
"American Gut Project on dünaamiline, proove saabub iga päev kogu maailmast," lisab Knight.
"Selles artiklis esitatud analüüs kujutab endast ühte pilti, kuid me tahame lõpuks minna kaugemale mikrobiomi kaartide tegemisest kuni mikrobiomi GPS-i loomiseni, mis ei ütle teile mitte ainult seda, kus te sellel kaardil asute, vaid ka seda, kuhu soovite minna ja mida teha dieedi, elustiili või ravimite osas sinna jõudmiseks. "
Rob Knight, Ph.D.
